一、表觀遺傳修飾如何調控基因功能？

表觀遺傳學是研究在不改變DNA序列的前提下，通過化學修飾調控基因活性的學科。這類修飾不涉及遺傳密碼本身的變化，卻能穩定地影響基因的表達模式，并在細胞分裂中可能被繼承。其作用對象廣泛，涵蓋DNA、RNA及組蛋白等多個層面。例如，組蛋白尾部可發生甲基化、乙酰化等多種共價修飾，這些修飾通過改變染色質的空間結構與電化學特性，決定基因轉錄的“開"或“關"。DNA甲基化正是其中一種核心的DNA層面修飾，因其在發育、疾病中的關鍵作用而成為研究焦點。區別于微小RNA等調控方式，DNA甲基化直接作用于基因組DNA，建立了一種相對穩定且可遺傳的“分子標記"系統，深刻影響著細胞命運與機體健康。

二、DNA甲基化的主要形式與分布特點是什么？

在高等真核生物如人類中，最主要的DNA甲基化形式是胞嘧啶第五位碳原子的甲基化，生成5-甲基胞嘧啶。該修飾主要發生在基因組中胞嘧啶-鳥嘌呤二核苷酸序列的胞嘧啶上。人類基因組中CpG位點分布不均，約60-80%的CpG位點處于甲基化狀態，這些位點廣泛分布于基因間區與重復序列，有助于維持基因組穩定性。而約有1%的基因組區域富含CpG序列，稱為CpG島，它們常與基因啟動子區域重疊。在正常細胞中，大多數CpG島處于非甲基化狀態，以保持相關基因的轉錄潛能；當其發生異常高甲基化時，往往導致基因沉默。這種全局性低甲基化與局部（特別是啟動子區）高甲基化并存的模式，是腫瘤等疾病中常見的甲基化景觀特征。

三、DNA甲基化檢測有哪些主流技術？

DNA甲基化的精準檢測是研究的基礎，其“金標準"方法是亞硫酸氫鹽處理。該化學處理能將未甲基化的胞嘧啶轉化為尿嘧啶，而甲基化的胞嘧啶保持不變，從而通過后續測序或雜交來區分甲基化狀態。基于此原理，發展出兩大類主流技術：甲基化芯片與甲基化測序。甲基化芯片（如850K芯片）具有通量高、成本相對較低、數據分析流程成熟等優勢，適用于大樣本篩查，其探針設計覆蓋了CpG島、啟動子、增強子等多個功能區域。甲基化測序則能提供單堿基分辨率的全基因組信息，主要包括：全基因組甲基化測序（提供全面的信息，但成本高）、簡化代表性甲基化測序（通過酶切富集CpG富集區域，性價比高）以及基于免疫沉淀的甲基化DNA測序等。針對5-甲基胞嘧啶的氧化衍生物（如5-羥甲基胞嘧啶）的檢測，則需要氧化亞硫酸氫鹽測序等特殊技術。此外，對于特定基因或位點的驗證，也可采用甲基化特異性PCR、焦磷酸測序等低通量方法。

四、DNA甲基化在生物學過程中有何關鍵作用？

DNA甲基化參與調控眾多核心生物學過程，對胚胎發育、細胞分化、基因組印記和X染色體失活等至關重要。在發育過程中，甲基化譜式經歷劇烈的動態重編程，以建立不同的細胞命運。在成體組織中，它維持細胞特異性基因表達程序的穩定。其生物學效應主要通過兩種機制實現：一是直接阻止轉錄因子與DNA結合；二是招募具有甲基化結合結構域的蛋白，后者進而募集組蛋白修飾酶與染色質重塑復合物，共同形成抑制性的染色質環境。異常DNA甲基化與多種疾病密切相關。在腫瘤中，普遍存在全基因組低甲基化（可能導致基因組不穩定和癌基因激活）與抑癌基因啟動子區高甲基化（導致其沉默）并存的現象。此外，神經精神性疾病、自身免疫病及代謝性疾病中也觀察到特異的甲基化異常。

五、DNA甲基化研究有哪些重要應用前景？

DNA甲基化標志物在轉化醫學中展現出巨大潛力。在腫瘤領域，基于血液等體液中循環游離DNA的甲基化檢測，可用于癌癥的早期篩查、風險預測、分子分型與預后評估。例如，通過機器學習對腦腫瘤樣本的甲基化譜進行分析，已能實現精準的分子分型，輔助臨床診斷與治療決策。在農業領域，植物DNA甲基化研究揭示了其在生長發育、環境脅迫響應及重要農藝性狀（如產量、果實成熟）形成中的作用，為作物遺傳改良提供了新靶點。此外，針對DNA甲基化修飾酶的藥物研發（如DNA甲基轉移酶抑制劑）已在骨髓增生異常綜合征等血液腫瘤治療中取得臨床應用，展示了表觀遺傳靶向治療的可行性。

六、提供甲基化的廠商有哪些？

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產品信息

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DNA甲基化為何是表觀遺傳研究的核心？